48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3145 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  100 
 
 
337 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  100 
 
 
337 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  64.29 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  40.19 
 
 
380 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  40.63 
 
 
386 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  36.87 
 
 
386 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  37.42 
 
 
343 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  31.36 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  31.36 
 
 
394 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  30.21 
 
 
415 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  29.73 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  28.96 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  30.15 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  33.1 
 
 
362 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  30.48 
 
 
389 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  27.75 
 
 
421 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  28.05 
 
 
343 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  28.75 
 
 
376 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  30.72 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  31.14 
 
 
388 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  31.2 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  29.06 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  30.03 
 
 
388 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  29.06 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  28.61 
 
 
401 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  27.36 
 
 
358 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  25.99 
 
 
377 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  28.32 
 
 
386 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  28.45 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  26.72 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  27.33 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  27.33 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  27.68 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  27.3 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  28.7 
 
 
403 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  29 
 
 
396 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  29.39 
 
 
402 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  28.44 
 
 
352 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  26.84 
 
 
279 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  24.77 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  27.09 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  28.43 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  25.3 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  24.43 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  24.14 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.92 
 
 
545 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  23.7 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  31.68 
 
 
119 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>