47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3405 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  81.84 
 
 
401 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  100 
 
 
395 aa  790    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  90.95 
 
 
397 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  79.03 
 
 
401 aa  624  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  58.92 
 
 
376 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  57.7 
 
 
421 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  43.48 
 
 
390 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  40.61 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  41.89 
 
 
383 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  38.38 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  38.4 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  36.6 
 
 
394 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  38.79 
 
 
396 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  38.79 
 
 
403 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  34.2 
 
 
343 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  34.95 
 
 
402 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  33.33 
 
 
377 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  32.8 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  31.79 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  32.96 
 
 
388 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  34.43 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  32.41 
 
 
388 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  33.24 
 
 
388 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  33.81 
 
 
409 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  32.49 
 
 
377 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  31.48 
 
 
386 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  31.55 
 
 
358 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  32.02 
 
 
365 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  32.65 
 
 
386 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  39.34 
 
 
352 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  28.34 
 
 
394 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  28.07 
 
 
394 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  27.3 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  27.3 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  26.72 
 
 
342 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  28.11 
 
 
386 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  30.41 
 
 
383 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  27.06 
 
 
386 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  29.66 
 
 
380 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  32.23 
 
 
383 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
545 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  27.78 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  27.93 
 
 
343 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  27.66 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  24.12 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  25.27 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  23.31 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>