49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6245 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  762    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  55.9 
 
 		 401 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  58.89 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  56.53 
 
 		 395 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  57.87 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  59.63 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  46.69 
 
 		 390 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  42.9 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  44.28 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  42.77 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  42.18 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  37.75 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  37.5 
 
 		 377 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  38.17 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  36.57 
 
 		 415 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  37.64 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  35.15 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  37.54 
 
 		 402 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  32.82 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  36.98 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  35.17 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  36.2 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  35.61 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  34.59 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  36.69 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  34.63 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  34.01 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  32.38 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  31.91 
 
 		 352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  32.59 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  30.49 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  28.75 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  28.75 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  29.79 
 
 		 394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  31.91 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  33.23 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  29.79 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  29.01 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  30.32 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  32.46 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  30.65 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  26.93 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  30.61 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  25.99 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  24.93 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  26.27 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.63 
 
 		 1236 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>