49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1433 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  100 
 
 
358 aa  736    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  49.41 
 
 
352 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  47.76 
 
 
366 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  47.55 
 
 
365 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  45.29 
 
 
374 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  35.84 
 
 
377 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  35.58 
 
 
383 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  28.86 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  32.73 
 
 
390 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  32.84 
 
 
402 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  32.82 
 
 
376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  33.81 
 
 
394 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  30.61 
 
 
403 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  31.3 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
545 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  32.02 
 
 
388 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  32.02 
 
 
388 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  28.7 
 
 
377 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  31.31 
 
 
396 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  32.2 
 
 
415 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  33.24 
 
 
394 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  31.8 
 
 
421 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  33.06 
 
 
401 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  29.75 
 
 
362 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  33.43 
 
 
401 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  31.56 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  29.63 
 
 
389 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  32.59 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  31.52 
 
 
386 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  31.55 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  27.36 
 
 
337 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  27.36 
 
 
337 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  29.8 
 
 
380 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  29.97 
 
 
409 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  27.65 
 
 
379 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  27.76 
 
 
386 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  26.53 
 
 
342 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  27.16 
 
 
386 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  24.85 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  28.2 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  25.16 
 
 
343 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  27.68 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  25.45 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  25.15 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  47.3 
 
 
102 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  38.32 
 
 
119 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  22.65 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  22.87 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  22.69 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>