98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7167 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  100 
 
 
199 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.16 
 
 
188 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.23 
 
 
166 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3057  glyoxalase family protein  46.11 
 
 
171 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2939  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.01 
 
 
190 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054707  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.25 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.75 
 
 
204 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.32 
 
 
326 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.86 
 
 
334 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
190 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.46 
 
 
176 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.12 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.7 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.9 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 
545 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.48 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.85 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0870171  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 
135 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 
164 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.67 
 
 
139 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
128 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  30.67 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  30.67 
 
 
139 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 
146 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  29.33 
 
 
139 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  30 
 
 
139 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  30 
 
 
139 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  30 
 
 
139 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  29.33 
 
 
139 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  29.33 
 
 
139 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  29.33 
 
 
139 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1946  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.1 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  33.61 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.95 
 
 
128 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0248  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  26.79 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.03 
 
 
127 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  30.6 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.67 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  26.79 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 
129 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  26.79 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1910  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
145 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 
135 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 
137 aa  48.5  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  29.1 
 
 
135 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.82 
 
 
128 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.71 
 
 
747 aa  48.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.33 
 
 
333 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  24.49 
 
 
129 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.82 
 
 
128 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
170 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.76 
 
 
151 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
151 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.51 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  29.31 
 
 
140 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  27.81 
 
 
135 aa  45.1  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.13 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.48 
 
 
134 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.61 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1393  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  25.15 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  25.85 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
175 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.03 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0565  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  28.39 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.31 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2649  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
126 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000551252  normal  0.306748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  24.54 
 
 
132 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 
126 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
132 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  29.06 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
132 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  33.04 
 
 
134 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  29.03 
 
 
133 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  24.82 
 
 
128 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  33.91 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  32.26 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.78 
 
 
167 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.77 
 
 
129 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  27.85 
 
 
134 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
126 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.66024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  25.87 
 
 
141 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  25.85 
 
 
129 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  33.04 
 
 
137 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  23.31 
 
 
166 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  26.06 
 
 
128 aa  41.6  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.69 
 
 
167 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1648  methylmalonyl-CoA epimerase  30.43 
 
 
158 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.62 
 
 
134 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  32.32 
 
 
163 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
141 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>