46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2876 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 189 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  84.94 
 
 		 166 aa  311  4.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  86.14 
 
 		 170 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  84.94 
 
 		 167 aa  306  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  84.94 
 
 		 167 aa  305  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  85.8 
 
 		 166 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.03 
 
 		 174 aa  299  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  81.33 
 
 		 166 aa  299  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  80.47 
 
 		 171 aa  298  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.54 
 
 		 166 aa  298  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  84.76 
 
 		 167 aa  298  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  83.13 
 
 		 167 aa  298  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  82.93 
 
 		 181 aa  296  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  80.24 
 
 		 167 aa  291  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.92 
 
 		 166 aa  286  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.73 
 
 		 165 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  57.99 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  43.87 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  43.87 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.58 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.95 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  41.94 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  43.31 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.22 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.75 
 
 		 326 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.45 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  27.03 
 
 		 133 aa  48.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.69 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.52 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.33 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.48 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  23.68 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.5 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.42 
 
 		 334 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  26.57 
 
 		 128 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  27.91 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.85 
 
 		 159 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  28.87 
 
 		 136 aa  41.6  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  28.3 
 
 		 140 aa  41.6  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  27.69 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.83 
 
 		 139 aa  41.2  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>