54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0996 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  100 
 
 		 166 aa  350  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  98.17 
 
 		 167 aa  340  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.24 
 
 		 170 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.18 
 
 		 167 aa  318  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  88.41 
 
 		 171 aa  317  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.48 
 
 		 174 aa  317  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.27 
 
 		 181 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  87.2 
 
 		 167 aa  309  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.27 
 
 		 167 aa  309  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.27 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  85.45 
 
 		 166 aa  305  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  87.2 
 
 		 166 aa  305  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  85.8 
 
 		 189 aa  303  9.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.33 
 
 		 166 aa  299  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  84.05 
 
 		 166 aa  296  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.88 
 
 		 165 aa  247  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  60.61 
 
 		 170 aa  211  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  45.51 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.2 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.95 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  44.94 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  42.31 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  42.31 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.37 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.33 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.45 
 
 		 334 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  27.03 
 
 		 133 aa  47.8  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.65 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.31 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.61 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.52 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.5 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  36.96 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.72 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.12 
 
 		 545 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  23.31 
 
 		 199 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  24.83 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000178969  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.33 
 
 		 326 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.54 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3643  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.36 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6216  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  27.81 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20.95 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.16 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>