53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3492 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  100 
 
 		 161 aa  333  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  90.06 
 
 		 161 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  88.82 
 
 		 161 aa  303  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  86.34 
 
 		 161 aa  296  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  84.66 
 
 		 163 aa  290  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  81.6 
 
 		 163 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  47.44 
 
 		 170 aa  156  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.79 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  47.77 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.94 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.23 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.54 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.3 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  46.5 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.31 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.67 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.5 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  45.22 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.41 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  42.31 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 		 189 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.95 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.32 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.35 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51788  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.45 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.05 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.83 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.97 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.34 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 545 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  21.79 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  21.79 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  25.52 
 
 		 133 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  23.81 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.87 
 
 		 139 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.56 
 
 		 334 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2714  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 		 313 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3641  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.35 
 
 		 352 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.75 
 
 		 326 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.83 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.54 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  22.15 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  24.83 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.66 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.29 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  24.83 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  24.83 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>