51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05255 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
167 aa  349  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  93.37 
 
 
174 aa  329  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  95.68 
 
 
167 aa  326  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  89.22 
 
 
171 aa  321  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.18 
 
 
181 aa  320  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  91.36 
 
 
166 aa  317  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.12 
 
 
167 aa  313  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.16 
 
 
170 aa  313  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.43 
 
 
167 aa  313  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.02 
 
 
167 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  87.2 
 
 
166 aa  309  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  86.14 
 
 
166 aa  306  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.73 
 
 
166 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.73 
 
 
166 aa  301  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  83.13 
 
 
189 aa  298  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.78 
 
 
165 aa  255  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  61.35 
 
 
170 aa  211  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  49.04 
 
 
161 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.51 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.84 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  47.77 
 
 
161 aa  144  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  45.51 
 
 
161 aa  143  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  47.8 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.75 
 
 
173 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.82 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.72 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.17 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.49 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.35 
 
 
326 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 
133 aa  44.7  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  25.15 
 
 
199 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7657  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
141 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.644401  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.76 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  25.17 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.61 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  25.17 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  25.17 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.97 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4649  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.49 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200798  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.08 
 
 
168 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 
135 aa  41.6  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  26.03 
 
 
133 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  23.84 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  28.12 
 
 
134 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6216  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.57 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.38 
 
 
545 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.08 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  55.17 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  27.34 
 
 
134 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>