48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2713 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  92.55 
 
 		 161 aa  310  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  90.06 
 
 		 161 aa  307  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.68 
 
 		 161 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  81.6 
 
 		 163 aa  280  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.75 
 
 		 163 aa  274  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  47.44 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.87 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.44 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.57 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  45.51 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.15 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.3 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.95 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.77 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  45.22 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  45.86 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  43.87 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.67 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.95 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.95 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  42.31 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.75 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.32 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51788  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.41 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.16 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  23.72 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  23.72 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.5 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  23.08 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.29 
 
 		 175 aa  43.9  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  26.97 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 		 545 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2714  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.7 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0565  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.74 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  24.66 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.36 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  24.67 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.55 
 
 		 326 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.14 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  24.16 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3641  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 		 352 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.258218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>