55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2365 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 170 aa  357  5e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  95.81 
 
 		 167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.76 
 
 		 174 aa  322  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  92.12 
 
 		 167 aa  320  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  90.24 
 
 		 166 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.76 
 
 		 167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  90.74 
 
 		 171 aa  318  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.02 
 
 		 181 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  89.16 
 
 		 167 aa  313  8e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.88 
 
 		 166 aa  310  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  86.14 
 
 		 189 aa  308  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  84.34 
 
 		 166 aa  306  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  85.89 
 
 		 167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.73 
 
 		 166 aa  305  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  81.33 
 
 		 166 aa  297  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 165 aa  238  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  59.28 
 
 		 170 aa  210  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  44.94 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.62 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.3 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  44.94 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  42.41 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  42.95 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.76 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 		 190 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  27.7 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.25 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.22 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.83 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  25 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.8 
 
 		 334 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.33 
 
 		 326 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.52 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4649  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.49 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  26.36 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  55.17 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  28.12 
 
 		 134 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.29 
 
 		 545 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 		 143 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  25.55 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.46 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  25.74 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  25.74 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.3 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>