216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2544 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3426  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.51 
 
 
135 aa  106  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.386923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  32.87 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.32 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.85 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1372  methylmalonyl-CoA epimerase  34.31 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0208267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  32.03 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  27.13 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  32.84 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  32.59 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  28.79 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  28.79 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  32.59 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  27.13 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  25.58 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  28.24 
 
 
128 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  28.24 
 
 
128 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.67 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
134 aa  52  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  29.53 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  32.12 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  32.85 
 
 
146 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.63 
 
 
128 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  31.82 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  26.52 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  28.24 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  28.89 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  29.93 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  29.93 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
161 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  32.31 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  29.55 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  28.24 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  32.33 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  29.32 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0958  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.39 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  28.03 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  28.03 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  26.87 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  26.36 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1264  methylmalonyl-CoA epimerase  31.65 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0685112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  25.58 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  33.58 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1264  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0246798 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.01 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  32.09 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  27.74 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  29.32 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  30.83 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  33.33 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  29.77 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  27.64 
 
 
199 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.86 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  31.91 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.22 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.86 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  25.58 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  31.62 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  27.27 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  28.12 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  30.94 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.43 
 
 
334 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  23.48 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
157 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  30.83 
 
 
134 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  29.01 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  30.6 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.53 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  30.37 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  30.22 
 
 
130 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.58 
 
 
204 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  29.01 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  29.01 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  29.01 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3418  hypothetical protein  31 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>