212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1233 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  79.53 
 
 
127 aa  206  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  76.19 
 
 
127 aa  201  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  73.81 
 
 
128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.22 
 
 
134 aa  194  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.87 
 
 
128 aa  189  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  71.43 
 
 
127 aa  188  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.08 
 
 
151 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  64.29 
 
 
129 aa  177  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.46 
 
 
127 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.46 
 
 
127 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.14 
 
 
127 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.866853  normal  0.0730884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2034  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.14 
 
 
127 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  67.46 
 
 
152 aa  173  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.35 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.35 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.75 
 
 
128 aa  170  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64 
 
 
129 aa  169  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2155  glyoxalase family protein  65.08 
 
 
127 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2496  glyoxylase I family protein  70.87 
 
 
127 aa  166  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3532  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.52 
 
 
127 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64 
 
 
129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.55 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00458  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64 
 
 
129 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  63.2 
 
 
130 aa  161  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  63.2 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.7 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  61.9 
 
 
128 aa  160  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  61.9 
 
 
128 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  61.9 
 
 
128 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  61.9 
 
 
128 aa  158  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  61.11 
 
 
128 aa  158  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  61.11 
 
 
136 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.2 
 
 
127 aa  157  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 
129 aa  157  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  157  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
128 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 
133 aa  157  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  61.11 
 
 
128 aa  156  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  61.11 
 
 
128 aa  155  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
129 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  60 
 
 
129 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
128 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  151  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.75 
 
 
129 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27488  normal  0.335444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.03 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.8 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1030  glyoxalase family protein  60.8 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3418  hypothetical protein  60.8 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3343  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.84 
 
 
129 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0958  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.02 
 
 
129 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.8 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0380  lactoylglutathione lyase related lyase  50.4 
 
 
130 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0158704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0663  glyoxylase family protein  60.78 
 
 
102 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35908e-32 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0667  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.11 
 
 
138 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0382094  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  48.09 
 
 
131 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  49.63 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01792  glyoxylase I family protein  62.26 
 
 
55 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41298  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.83 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.59 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2816  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 
318 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.81 
 
 
209 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462315  hitchhiker  0.000819499 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.82 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
209 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
126 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.66024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
180 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 
193 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
124 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2649  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000551252  normal  0.306748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
196 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2381  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.16 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2895  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  32.84 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3717  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
224 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457421  normal  0.0789561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2053  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.573082  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.39 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>