80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01756 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.06 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.36 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.37 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.73 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.36 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3407  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.25 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.85 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.6 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.53 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0339322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5103  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.36 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2895  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.97 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.93 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2381  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.43 
 
 		 206 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3867  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.93 
 
 		 180 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3717  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457421  normal  0.0789561 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1559  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.84 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.97 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2527  hypothetical protein  39.63 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0933862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.93 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.089517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.71 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.69 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0836593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.3 
 
 		 209 aa  91.3  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.98 
 
 		 209 aa  90.9  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462315  hitchhiker  0.000819499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.26 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.24 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1324  glyoxalase/bleomycin resistance protein  38.97 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.991204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4358  glyoxalase family protein  31.74 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.1 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4899  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.19 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2477  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000526375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  32.84 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1117  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.6 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2702  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 138 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3401  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 138 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  30.19 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3421  hypothetical protein  35.51 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.393766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.84 
 
 		 127 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  31.62 
 
 		 127 aa  48.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.53 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.52 
 
 		 297 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5486  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1827  ring-cleaving dioxygenase  24.44 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3974  lactoylglutathione lyase  27.22 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.094624  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3471  hypothetical protein  24.26 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4213  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  27.38 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  27.38 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  26.19 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.604532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  27.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0496  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.69 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  27.61 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2213  hypothetical protein  30.28 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.666826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3223  hypothetical protein  27.08 
 
 		 126 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 		 128 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0508  ring-cleaving dioxygenase  25.36 
 
 		 132 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319055  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  28.78 
 
 		 146 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.86 
 
 		 126 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  31.11 
 
 		 127 aa  41.6  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2482  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204779  normal  0.0473922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0971  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.475756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>