73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0280 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
175 aa  367  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2973  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1041  hypothetical protein  34.76 
 
 
192 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.46 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5103  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.03 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2477  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000526375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2381  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2895  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.61 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3974  lactoylglutathione lyase  30.86 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.094624  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3717  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457421  normal  0.0789561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2527  hypothetical protein  29.86 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0933862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.604532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.12 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462315  hitchhiker  0.000819499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.41 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3407  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 
202 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0827637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1140  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.8 
 
 
211 aa  62.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3867  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.18 
 
 
180 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.88 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.99 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.75 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.87 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1117  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.81 
 
 
229 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 
292 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  25.41 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.37 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.74 
 
 
367 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.99 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.089517  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.92 
 
 
297 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.05 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.58 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1324  glyoxalase/bleomycin resistance protein  28.31 
 
 
180 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.991204  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.68 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1567  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
194 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0577419  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.76 
 
 
181 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1805  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.44 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1686  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.65 
 
 
311 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0451739  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.69 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1559  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.48 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0304  glyoxalase family protein  29.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.74 
 
 
182 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
179 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0836593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.138703 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1001  putative ring-cleavage dioxygenase  28.15 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1548  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.86 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  28.28 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0273  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.85 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.03 
 
 
308 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000216536  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3220  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.03 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123304  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.12 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0396  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.03 
 
 
308 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184012  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3471  hypothetical protein  25.9 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  28.99 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.82 
 
 
312 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0723215  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1242  hypothetical protein  28.17 
 
 
137 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.99 
 
 
159 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
137 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.991894  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.78 
 
 
181 aa  41.2  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.48 
 
 
317 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.581955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.99 
 
 
141 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
167 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0389  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.36 
 
 
131 aa  40.8  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>