79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3094 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
231 aa  484  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.604532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1117  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.95 
 
 
229 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1140  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.5 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0304  glyoxalase family protein  33.8 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1548  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.47 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1805  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.76 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1567  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.09 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0577419  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5103  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.16 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.29 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.81 
 
 
185 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
181 aa  61.6  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2895  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2381  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290002  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
182 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
180 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 
177 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3717  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457421  normal  0.0789561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3407  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.08 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0827637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.15 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462315  hitchhiker  0.000819499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 
196 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.42 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2477  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.68 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000526375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3867  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 
180 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2527  hypothetical protein  24.03 
 
 
176 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0933862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3974  lactoylglutathione lyase  28.9 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.094624  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.089517  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.21 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.83 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1559  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.49 
 
 
191 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5486  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.33 
 
 
140 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.138703 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.49 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.45 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.65 
 
 
160 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1057  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.01 
 
 
326 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  24.52 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4358  glyoxalase family protein  19.59 
 
 
176 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.34 
 
 
211 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4899  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.34 
 
 
287 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1324  glyoxalase/bleomycin resistance protein  26.28 
 
 
180 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.991204  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3471  hypothetical protein  22.79 
 
 
170 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.07 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0836593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.84 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0339322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.99 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.66 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.44 
 
 
161 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0104076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.6 
 
 
367 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.52 
 
 
191 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.5 
 
 
292 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.82 
 
 
165 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.87 
 
 
169 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0552719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.07 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.72 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1041  hypothetical protein  25.85 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.84 
 
 
183 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.19 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0668  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.63 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3329  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1686  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.78 
 
 
311 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0451739  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3240  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 
310 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5249  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 
172 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5628  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 
172 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615046  normal  0.490927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5337  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 
172 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3501  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
310 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2991  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
310 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4076  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
310 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3062  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 
171 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0224113  normal  0.0364236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3220  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20.33 
 
 
259 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123304  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.17 
 
 
165 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1664  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
310 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960409  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.53 
 
 
169 aa  41.6  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>