80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3778 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.2 
 
 
286 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.45 
 
 
297 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4899  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.45 
 
 
287 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5486  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.25 
 
 
218 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.72 
 
 
182 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.64 
 
 
180 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3407  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.35 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0827637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.88 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1140  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.82 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.28 
 
 
209 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462315  hitchhiker  0.000819499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5103  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.42 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.8 
 
 
181 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2895  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.72 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2381  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.72 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3717  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457421  normal  0.0789561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2527  hypothetical protein  32.88 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0933862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5485  hypothetical protein  43.75 
 
 
90 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.24 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.42 
 
 
193 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.09 
 
 
179 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.17 
 
 
185 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.61 
 
 
176 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.51 
 
 
179 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.62 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.51 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.8 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.66 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.089517  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3867  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.05 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 
177 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1559  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.19 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.76 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  27.17 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.81 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1567  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.79 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0577419  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.62 
 
 
183 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0836593 
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  33.1 
 
 
180 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.58 
 
 
179 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.62 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4358  glyoxalase family protein  30.56 
 
 
176 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2477  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
184 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000526375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3974  lactoylglutathione lyase  28.31 
 
 
184 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.094624  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2213  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.666826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.62 
 
 
183 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
183 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0339322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1548  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.56 
 
 
194 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4213  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
169 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1324  glyoxalase/bleomycin resistance protein  30.92 
 
 
180 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.991204  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.35 
 
 
165 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.22 
 
 
167 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 
175 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2973  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0304  glyoxalase family protein  27.46 
 
 
199 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1041  hypothetical protein  30.82 
 
 
192 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3471  hypothetical protein  27.56 
 
 
170 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.58 
 
 
160 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1805  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
204 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.39 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.138703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1117  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.42 
 
 
229 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3220  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.71 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123304  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1057  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1772  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.16 
 
 
204 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.08 
 
 
312 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0273  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
206 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1325  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.94 
 
 
123 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.22 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0723215  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.5 
 
 
231 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.604532 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.21 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.96 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0317  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.96 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0308  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.96 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0174  glyoxalase family protein  28.8 
 
 
134 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1803  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
137 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.991894  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1242  hypothetical protein  32.54 
 
 
137 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0168  glyoxalase family protein  28.8 
 
 
149 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
367 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1686  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0451739  normal  0.811367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>