58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1041 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.76 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2527  hypothetical protein  32.21 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0933862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3407  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.41 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3717  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457421  normal  0.0789561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.28 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5103  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.33 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.87 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.72 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462315  hitchhiker  0.000819499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1140  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2381  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2895  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2477  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.75 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000526375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.88 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1548  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.17 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3974  lactoylglutathione lyase  25.86 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.094624  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.089517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.82 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.82 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.14 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1559  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.39 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.69 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.86 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0836593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.73 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0339322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0304  glyoxalase family protein  25 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000398069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4213  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.41 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3867  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.85 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.11 
 
 		 297 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  24.32 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.32 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1324  glyoxalase/bleomycin resistance protein  27.4 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.991204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2213  hypothetical protein  27.91 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.666826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.22 
 
 		 286 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4899  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1772  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.08 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1805  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.99 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 		 367 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.85 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.604532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.61 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1117  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.97 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5486  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.48 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4358  glyoxalase family protein  22.75 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.65 
 
 		 176 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>