78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0619 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
173 aa  350  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0908  hypothetical protein  39.39 
 
 
153 aa  91.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.71 
 
 
133 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.22 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.5 
 
 
128 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.272644  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3357  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3244  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3419  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.49935  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.43 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2811  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.61 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3459  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.43 
 
 
132 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
367 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5628  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615046  normal  0.490927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5337  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5249  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1057  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
326 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  33.06 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2319  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26 
 
 
324 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4547  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.86 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0455  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.56 
 
 
335 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  31.2 
 
 
128 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 
136 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.135989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5759  hypothetical protein  33.61 
 
 
127 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442301  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.15 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2503  Glutathione transferase  35.56 
 
 
135 aa  47.8  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  32.54 
 
 
127 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2409  Glutathione transferase  35.29 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  30.71 
 
 
128 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3471  hypothetical protein  31.06 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6339  hypothetical protein  32.12 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00130236  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  29.27 
 
 
128 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  34.68 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2185  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.94 
 
 
129 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0386322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1738  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
147 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1567  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.88 
 
 
194 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0577419  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4213  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4270  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.092254  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  29.69 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  30.83 
 
 
128 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  27.56 
 
 
128 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  29.92 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  29.92 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4324  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.7 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  30.08 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0820  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.03 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  24.26 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282655  normal  0.113299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.57 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2973  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  29.13 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0365  ABC transporter periplasmic protein  28.12 
 
 
316 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.722785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0304  glyoxalase family protein  26.32 
 
 
199 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  30.37 
 
 
131 aa  42  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
176 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2466  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.87 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 
117 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3188  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
313 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
133 aa  41.2  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.19 
 
 
312 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0723215  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
123 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0349586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0936  ribosomal protein L14  29.13 
 
 
127 aa  40.8  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 
124 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
137 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147506 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 
126 aa  40.8  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0380  lactoylglutathione lyase related lyase  26.28 
 
 
130 aa  40.8  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0158704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3246  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
117 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>