47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3244 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3244  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
127 aa  256  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.54 
 
 
130 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3459  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.94 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3357  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3419  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.49935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0908  hypothetical protein  36.22 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2811  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.77 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.7 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.272644  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1738  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.5 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5759  hypothetical protein  32.54 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442301  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.8 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4270  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.19 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.092254  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  30.53 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6339  hypothetical protein  31.78 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00130236  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
312 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0723215  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  35.11 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3471  hypothetical protein  28.79 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1441  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.909465 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 
296 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435339  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  28.57 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.53 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  33.33 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.158959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2503  Glutathione transferase  34.04 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0697  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5638  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2482  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
184 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204779  normal  0.0473922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  27.82 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.98 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  27.82 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282655  normal  0.113299 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  28.03 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0308  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0496645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  27.21 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  31.15 
 
 
309 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>