41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4270 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4270  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
140 aa  276  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.092254  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3419  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.49935  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3357  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3459  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.31 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.93 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.272644  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.61 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2811  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1738  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.33 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3244  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.19 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.46 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4547  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.88 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  31.74 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  31.74 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  31.74 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6339  hypothetical protein  28.99 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00130236  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0803  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0908  hypothetical protein  28.79 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3062  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.82 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0224113  normal  0.0364236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  29.75 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  28.38 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  28.29 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 
176 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  27.63 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  31.11 
 
 
314 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  29.73 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  31.11 
 
 
314 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  28.3 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.14 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.349547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  31.21 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  30.38 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2970  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.76 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495253  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0374  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  28.29 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  27.63 
 
 
173 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
173 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>