35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0803 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0803  glyoxalase family protein  100 
 
 
130 aa  270  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  65.38 
 
 
143 aa  185  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1893  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.39 
 
 
166 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00822676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  50.78 
 
 
134 aa  134  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48 
 
 
144 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000291195  normal  0.059306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1306  hypothetical protein  48 
 
 
144 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5689  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.69 
 
 
181 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883457  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4733  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.46 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232929  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.53 
 
 
136 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.135989 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34859  predicted protein  39.39 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0311877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4270  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.092254  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.94 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
217 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.53 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0178  lactoylglutathione lyase related lyase  29.46 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00765749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  27.88 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  31.11 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  30.16 
 
 
362 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.272644  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0908  hypothetical protein  25.98 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
155 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3398  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  29.11 
 
 
140 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 
135 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.76 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451164  unclonable  0.00000000000414135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.12 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  28.89 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.57 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2048  methylmalonyl-CoA epimerase  26.98 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.19 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.349547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>