280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0016 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
179 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  70.79 
 
 
180 aa  276  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  67.98 
 
 
184 aa  269  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  68.54 
 
 
205 aa  262  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  70.41 
 
 
166 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  54.75 
 
 
181 aa  210  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  56.4 
 
 
182 aa  208  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  57.3 
 
 
176 aa  203  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  56.74 
 
 
176 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  60.25 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  59.35 
 
 
188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  59.35 
 
 
189 aa  195  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  55.15 
 
 
173 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  52.38 
 
 
175 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  53.94 
 
 
175 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  52.73 
 
 
173 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  52.17 
 
 
175 aa  184  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  52.73 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  53.33 
 
 
175 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  52.12 
 
 
173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  51.48 
 
 
185 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  50.87 
 
 
180 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  52.5 
 
 
171 aa  174  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  50.61 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  48 
 
 
182 aa  171  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  50 
 
 
175 aa  170  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  46.11 
 
 
318 aa  144  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  45 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  44.59 
 
 
310 aa  121  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  37.5 
 
 
321 aa  118  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  35.9 
 
 
135 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  35.9 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  39.22 
 
 
128 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  35.48 
 
 
135 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  35.9 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  35.9 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  35.9 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  36.36 
 
 
158 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  37.5 
 
 
130 aa  89  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  38.56 
 
 
136 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  36.6 
 
 
133 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  36.18 
 
 
145 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  37.33 
 
 
129 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  36.84 
 
 
132 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  35.06 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  38.46 
 
 
136 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  35.48 
 
 
130 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  35.9 
 
 
135 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  34.62 
 
 
135 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  37.09 
 
 
127 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  39.07 
 
 
138 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  36.84 
 
 
136 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  36.67 
 
 
135 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  35.53 
 
 
130 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  37.33 
 
 
138 aa  84.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  37.33 
 
 
138 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  37.5 
 
 
132 aa  84.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  34.21 
 
 
128 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  38.16 
 
 
128 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  33.97 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  33.97 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  33.97 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  34.16 
 
 
137 aa  84.3  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  34.87 
 
 
143 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  34.84 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  33.97 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  35.53 
 
 
128 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  37.75 
 
 
146 aa  84.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  33.97 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  33.97 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  34.87 
 
 
143 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  33.97 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  34.84 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06332  lactoylglutathione lyase (Glo1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13550)  32.46 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  34.84 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  33.55 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  36.91 
 
 
127 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  36.6 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  36.18 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  35.57 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  36.18 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  33.97 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  34.9 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  37.33 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  34.9 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  32.9 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  36.84 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  33.33 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  34.23 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  35.57 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  36.24 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  32.89 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  35.33 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  33.97 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  33.56 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  36.84 
 
 
128 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  38.56 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  36.67 
 
 
138 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2111  glyoxalase I  38.36 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>