123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1846 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  100 
 
 
143 aa  298  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0803  glyoxalase family protein  65.38 
 
 
130 aa  185  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.65 
 
 
144 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000291195  normal  0.059306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1893  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.8 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00822676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  58.14 
 
 
134 aa  144  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1306  hypothetical protein  51.2 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4733  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.12 
 
 
140 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232929  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5689  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.66 
 
 
181 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883457  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.66 
 
 
136 aa  130  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.135989 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34859  predicted protein  45.93 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0311877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4192  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.08 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  34.52 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0605  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  29.06 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.87 
 
 
217 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.09 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  31.58 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  34.94 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  34.52 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.16 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  26.72 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.13 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  30.53 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  30.4 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  28.68 
 
 
128 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.67 
 
 
129 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  26.81 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
137 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
204 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.1 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  32.18 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0908  hypothetical protein  31.01 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2048  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.272644  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  30.23 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.18 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  27.64 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.31 
 
 
279 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  27.64 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  27.05 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  28.07 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  26.19 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  27.82 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
238 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  28.91 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  29.01 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  29.01 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  29.32 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4270  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.092254  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  28.35 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  28.68 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  28.15 
 
 
329 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  27.13 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  25.38 
 
 
326 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.26 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  27.82 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4104  hypothetical protein  30.48 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 
296 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 
296 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.569022  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6219  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.71 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000185613  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0432529  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  29.76 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2765  fosfomycin resistance protein  27.27 
 
 
155 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000231179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0178  lactoylglutathione lyase related lyase  27.91 
 
 
126 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00765749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2746  fosfomycin resistance protein  26.92 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.876802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2546  fosfomycin resistance protein  26.92 
 
 
155 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.658002  hitchhiker  0.00000000325933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  28.57 
 
 
128 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  27.13 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  27.68 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  28.19 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  27.91 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  28.36 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  31.87 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  27.13 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  29.76 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  28.99 
 
 
303 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.17 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.15 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.75 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0552719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>