97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4624 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  100 
 
 
314 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  100 
 
 
314 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  91.72 
 
 
314 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  84.71 
 
 
314 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  84.71 
 
 
314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  82.17 
 
 
314 aa  554  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  81.21 
 
 
314 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2964  catechol 2,3-dioxygenase  75.16 
 
 
314 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0413409  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1182  catechol 2,3-dioxygenase  60.19 
 
 
314 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2277  metapyrocatechase  45.89 
 
 
310 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.98 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  45.4 
 
 
309 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  43.99 
 
 
304 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  46.2 
 
 
309 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.42 
 
 
311 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  45.4 
 
 
309 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3789  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.81 
 
 
308 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.01416e-18  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  45.43 
 
 
311 aa  258  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08720  Catechol 2,3 dioxygenase, XylE  42.54 
 
 
307 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  43.95 
 
 
308 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  42.68 
 
 
306 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  44.3 
 
 
303 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.13 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  32.07 
 
 
328 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  31.01 
 
 
335 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  30.38 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  31.6 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.17 
 
 
320 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  29.86 
 
 
326 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  28.66 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  31.07 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.93 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  28.72 
 
 
315 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  28.71 
 
 
332 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.66 
 
 
388 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3523  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.59 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3021  putative catechol 2,3-dioxygenase  28.09 
 
 
304 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  29.07 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2314  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.41 
 
 
322 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.59 
 
 
363 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.76 
 
 
304 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1775  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.67 
 
 
314 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2641  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.9 
 
 
351 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67921  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.21 
 
 
306 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2612  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.9 
 
 
289 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.9 
 
 
289 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.185638  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1330  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.21 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00370431  normal  0.041902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.59 
 
 
325 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2419  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.21 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.24 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4021  Catechol 2,3-dioxygenase  26.13 
 
 
319 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.686433  normal  0.0157574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.96 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.23 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.03 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0995  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.39 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0341301  normal  0.0115779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.39 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  23.33 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  24.92 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.17 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.52 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000107078  hitchhiker  0.00208557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1548  Catechol 2,3-dioxygenase  24.83 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.832189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.83 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.31 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  21.51 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.07 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.18 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.05 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.74 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3843  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  23.21 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.724858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.68 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  27.16 
 
 
201 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.84 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5318  oxidoreductase  23.7 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  24.91 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01659  oxidoreductase protein  22.73 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2877  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.38 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2669  biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  23.74 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0761655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1465  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.02 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0640  aromatic ring-cleavage dioxygenase  22.65 
 
 
301 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000774206  normal  0.0582062 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5525  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.81 
 
 
299 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.12 
 
 
279 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  22.31 
 
 
297 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.26 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207462  normal  0.0759343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.26 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20.94 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.06 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.78 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4707  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.02 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3164  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.03 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4793  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.02 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  27.38 
 
 
180 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1492  glyoxalase family protein  21.72 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7068  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0884954  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3684  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.79 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.77 
 
 
336 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>