292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3106 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
173 aa  363  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  95.95 
 
 
173 aa  349  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  84.39 
 
 
173 aa  314  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  80.92 
 
 
175 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  80.35 
 
 
175 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  79.77 
 
 
175 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  79.19 
 
 
175 aa  297  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  72.09 
 
 
175 aa  270  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  71.01 
 
 
171 aa  254  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  68.39 
 
 
185 aa  246  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  64.91 
 
 
175 aa  237  5e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  64.33 
 
 
175 aa  235  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  56.29 
 
 
182 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  54.55 
 
 
181 aa  200  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  58.02 
 
 
176 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  58.02 
 
 
176 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  55.76 
 
 
184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  54.55 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  54.94 
 
 
205 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  52.12 
 
 
179 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  54.14 
 
 
166 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  52.66 
 
 
180 aa  175  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  51.15 
 
 
182 aa  174  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  52.32 
 
 
318 aa  164  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  49.68 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  48.7 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  48.05 
 
 
188 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  48.37 
 
 
166 aa  136  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  43.71 
 
 
310 aa  129  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  45.16 
 
 
321 aa  127  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  37.93 
 
 
136 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  37.24 
 
 
127 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  37.24 
 
 
136 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  37.93 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  37.84 
 
 
130 aa  91.3  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 
138 aa  91.3  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  35.62 
 
 
130 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  34.42 
 
 
136 aa  90.9  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 
138 aa  91.3  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  33.79 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  33.79 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  35.81 
 
 
130 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
131 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  35.14 
 
 
128 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 
138 aa  89  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  36.55 
 
 
129 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 
138 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 
129 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  35.17 
 
 
135 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
129 aa  88.2  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  38.19 
 
 
127 aa  87.8  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 
129 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  35.17 
 
 
137 aa  87.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06332  lactoylglutathione lyase (Glo1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13550)  32.02 
 
 
225 aa  86.3  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  34.25 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
238 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  35.17 
 
 
129 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  34.01 
 
 
136 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  33.1 
 
 
135 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  33.1 
 
 
135 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
135 aa  85.5  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
129 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
129 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
129 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
138 aa  85.1  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
129 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
129 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
129 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  35.86 
 
 
135 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  34.48 
 
 
129 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  32.41 
 
 
135 aa  84.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  35.17 
 
 
128 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
135 aa  84.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  35.86 
 
 
135 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  35.86 
 
 
135 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  35.86 
 
 
135 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  35.86 
 
 
135 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  33.79 
 
 
135 aa  84.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  31.54 
 
 
130 aa  84  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  35.86 
 
 
128 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  32.89 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  34.44 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  35.62 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  33.1 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  35.48 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  33.56 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.86 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  33.1 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  33.79 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2343  lactoylglutathione lyase  38.36 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.973828  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  33.79 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02739  glyoxalase I, nickel isomerase (Lactoylglutathione lyase)  32.21 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.206063  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  33.79 
 
 
135 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1268  lactoylglutathione lyase  37.24 
 
 
146 aa  82  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>