283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2101 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
175 aa  366  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  93.14 
 
 
175 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  93.14 
 
 
175 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  92.57 
 
 
175 aa  343  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  79.77 
 
 
173 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  79.19 
 
 
173 aa  297  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  79.77 
 
 
173 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  70.69 
 
 
175 aa  275  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  68.39 
 
 
185 aa  251  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  66.86 
 
 
171 aa  244  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  64.33 
 
 
175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  63.74 
 
 
175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  58.08 
 
 
181 aa  204  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  54.07 
 
 
182 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  56.36 
 
 
180 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  56.79 
 
 
176 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  56.79 
 
 
176 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  57.58 
 
 
205 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  52.38 
 
 
179 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  53.61 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  55.28 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  51.15 
 
 
182 aa  176  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  49.43 
 
 
180 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  54.3 
 
 
318 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  50.32 
 
 
181 aa  160  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  45.45 
 
 
188 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  44.89 
 
 
189 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  49.36 
 
 
166 aa  145  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  43.31 
 
 
321 aa  132  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  44.59 
 
 
310 aa  132  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  36.36 
 
 
136 aa  94.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  37.58 
 
 
131 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  38.26 
 
 
136 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  39.33 
 
 
130 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  38.67 
 
 
128 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  37.41 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  36.24 
 
 
136 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  38.67 
 
 
129 aa  88.6  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  35.14 
 
 
138 aa  88.2  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 
158 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  37.84 
 
 
128 aa  87.4  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  39.46 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  36.49 
 
 
130 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  34.01 
 
 
143 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  34.01 
 
 
143 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 
128 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  36.91 
 
 
138 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  36.24 
 
 
129 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  36.67 
 
 
129 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  37.33 
 
 
128 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 
129 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  36.73 
 
 
129 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  37.24 
 
 
138 aa  84.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  33.11 
 
 
135 aa  84.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
135 aa  84.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 
129 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  36.24 
 
 
137 aa  84.3  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  34.9 
 
 
128 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  37.41 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  36.91 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  34.21 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  32.65 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  33.1 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  36.49 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  35.37 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  34.87 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  35.57 
 
 
145 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  38 
 
 
132 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
135 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 
128 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  34.48 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.86 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.14 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  32.67 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  33.78 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  36.24 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  33.78 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  33.78 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  33.56 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  33.78 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  33.78 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  36 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  34.69 
 
 
133 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
142 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  33.78 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  35.37 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>