44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5214 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282655  normal  0.113299 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7657  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.52 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.644401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1481  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2048  methylmalonyl-CoA epimerase  32.56 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4104  hypothetical protein  27.48 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0432529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  28.35 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6219  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000185613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1264  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.84 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0246798 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.76 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  34.65 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  30.2 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  34.34 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  31.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.36 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2407  methylmalonyl-CoA epimerase  31.85 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2198  methylmalonyl-CoA epimerase  31.58 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  30.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  28.79 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  29.32 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2934  methylmalonyl-CoA epimerase  31.62 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0818  glyoxalase family protein  30.37 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.97 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 		 159 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 545 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  30.37 
 
 		 134 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2630  putative glyoxalase  30.3 
 
 		 134 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0581567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1306  hypothetical protein  26.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  31.68 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  30.43 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6135  methylmalonyl-CoA epimerase  30.3 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00511607  normal  0.152762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.49 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3244  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  33.6 
 
 		 130 aa  40.8  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1664  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.93 
 
 		 370 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1803  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.74 
 
 		 316 aa  40.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>