105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2048 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2048  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  96.83 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0432529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4104  hypothetical protein  48.82 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6219  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.24 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000185613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7657  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.644401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1481  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282655  normal  0.113299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.616957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1264  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0246798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5312  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2999  glyoxalase family protein  27.19 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441572  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2694  hypothetical protein  27.19 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6021  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.346989  normal  0.446573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  27.74 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  28.26 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  29.41 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  26.95 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  37.5 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  36.46 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5509  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.524935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.56 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000851602  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  28.32 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.89 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  26.36 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  27.27 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  24.35 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  26.55 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  26.55 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  26.55 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  26.55 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  26.55 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  27.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  26.67 
 
 		 136 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  26.12 
 
 		 128 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  26.85 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  24.35 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  24.35 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  25.38 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0511  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  30.12 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.81 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  25.93 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4555  hypothetical protein  42.11 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2269  lactoylglutathione lyase  42.11 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  42.11 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000866783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  42.11 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  42.11 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  30.39 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.59 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  26.85 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  44.74 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  26.43 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  25.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  25.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  25.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.81 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1434  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.39 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1450  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582503  hitchhiker  0.000352028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  28.24 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  25.71 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  27.27 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1552  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  23.48 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  25.6 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0803  glyoxalase family protein  26.98 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  24.55 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  28.43 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  23.85 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  24.81 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.459342  normal  0.516309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  25.58 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>