192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2198 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2198  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 
136 aa  273  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1369  methylmalonyl-CoA epimerase  76.87 
 
 
134 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1277  methylmalonyl-CoA epimerase  76.87 
 
 
134 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149828  normal  0.902197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  75.19 
 
 
134 aa  215  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2630  putative glyoxalase  76.12 
 
 
134 aa  209  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0581567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  74.63 
 
 
134 aa  209  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  75.94 
 
 
134 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.94 
 
 
134 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0906  methylmalonyl-CoA epimerase  73.13 
 
 
134 aa  208  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61726  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  75.94 
 
 
134 aa  208  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2407  methylmalonyl-CoA epimerase  75.37 
 
 
134 aa  207  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  75.37 
 
 
134 aa  207  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.19 
 
 
134 aa  206  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4617  methylmalonyl-CoA epimerase  74.63 
 
 
134 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_004310  BR0818  glyoxalase family protein  74.63 
 
 
134 aa  204  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  75.19 
 
 
134 aa  204  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  73.88 
 
 
134 aa  202  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  74.63 
 
 
134 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  73.68 
 
 
134 aa  202  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1572  methylmalonyl-CoA epimerase  73.68 
 
 
134 aa  201  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2934  methylmalonyl-CoA epimerase  73.13 
 
 
134 aa  197  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1003  methylmalonyl-CoA epimerase  68.66 
 
 
134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2043  methylmalonyl-CoA epimerase  71.43 
 
 
134 aa  194  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370344  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4545  methylmalonyl-CoA epimerase  69.4 
 
 
134 aa  193  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0847692  normal  0.36006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1198  methylmalonyl-CoA epimerase  67.91 
 
 
134 aa  192  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1069  methylmalonyl-CoA epimerase  67.91 
 
 
134 aa  192  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17549  normal  0.247158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.66 
 
 
134 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.295419  normal  0.1439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2590  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.4 
 
 
134 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223231  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2420  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.91 
 
 
134 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.132451  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2869  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.91 
 
 
134 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15489  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3282  methylmalonyl-CoA epimerase  67.91 
 
 
134 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.42 
 
 
134 aa  186  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  68.66 
 
 
133 aa  181  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3210  methylmalonyl-CoA epimerase  58.65 
 
 
134 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0791094  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6135  methylmalonyl-CoA epimerase  57.58 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00511607  normal  0.152762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1372  methylmalonyl-CoA epimerase  57.14 
 
 
139 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0208267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2814  methylmalonyl-CoA epimerase  53.03 
 
 
138 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744827  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  52.67 
 
 
141 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1220  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.72 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.019887  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  46.27 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  44.53 
 
 
146 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  45.11 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.03 
 
 
134 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.54 
 
 
134 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
134 aa  104  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  42.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  42.54 
 
 
134 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
135 aa  100  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  41.98 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  41.35 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  40.6 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  39.26 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  40.15 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.12 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.94 
 
 
133 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  36.64 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  37.78 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.22 
 
 
158 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.35 
 
 
134 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  35.94 
 
 
134 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  41.35 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.64 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 
136 aa  87  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  37.7 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  37.78 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  36.09 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  40.6 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  41.67 
 
 
163 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  37.78 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  35.92 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  40.6 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  38.73 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  39.86 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  36.92 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  35.66 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  38.03 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  38.03 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.33 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  39.01 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  41.09 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  33.85 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  41.09 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.33 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  34.53 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.32 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  35.25 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  41.09 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  37.98 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  36.72 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  38.06 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  34.53 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  36.15 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  36.92 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>