55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0212 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
165 aa  340  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.67 
 
 
167 aa  256  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.08 
 
 
166 aa  256  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  71.78 
 
 
167 aa  255  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.48 
 
 
167 aa  255  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.28 
 
 
181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.51 
 
 
174 aa  250  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  68.29 
 
 
171 aa  248  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  67.88 
 
 
166 aa  247  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.68 
 
 
167 aa  244  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.08 
 
 
166 aa  238  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.08 
 
 
167 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 
170 aa  238  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.46 
 
 
166 aa  237  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  65.22 
 
 
166 aa  233  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  62.73 
 
 
189 aa  226  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  61.73 
 
 
170 aa  214  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  49.36 
 
 
161 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  46.79 
 
 
161 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.79 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  47.44 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.2 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  44.3 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.9 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.53 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.65 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.67 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4649  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
147 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200798  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.72 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.76 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282655  normal  0.113299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6216  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.97 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 
545 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.76 
 
 
334 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.48 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  28.7 
 
 
133 aa  45.1  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.19 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.52 
 
 
326 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.52 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51788  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.97 
 
 
160 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.17 
 
 
131 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0909  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.05 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  30.34 
 
 
145 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3643  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.85 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  26.04 
 
 
199 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.48 
 
 
182 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>