114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  82.07 
 
 
145 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  81.94 
 
 
151 aa  248  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  79.17 
 
 
145 aa  242  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1910  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  80.56 
 
 
145 aa  241  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1393  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.79 
 
 
146 aa  224  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.52 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.66 
 
 
158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1648  methylmalonyl-CoA epimerase  43.15 
 
 
158 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0248  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.66 
 
 
146 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
144 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2383  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.86 
 
 
150 aa  120  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611543  normal  0.517955 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6081  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.13 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3522  hypothetical protein  41.96 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1882  hypothetical protein  43.06 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1674  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.84 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2489  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.13 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1622  hypothetical protein  42.36 
 
 
151 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1931  hypothetical protein  42.36 
 
 
151 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.269466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1856  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.32929e-27 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5785  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.43 
 
 
145 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932614  normal  0.0358814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1675  hypothetical protein  40.97 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1810  hypothetical protein  40.97 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.281352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.45 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.55 
 
 
147 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2554  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.89 
 
 
151 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1935  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.55 
 
 
141 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00196313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2063  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4748  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.85 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2970  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.08 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495253  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  28.28 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.72 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.11 
 
 
188 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  32.73 
 
 
134 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  29.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  29.45 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.91 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  27.7 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  30.6 
 
 
199 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  30.91 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.97 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  26.24 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  26.24 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.04 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  26.24 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  26.24 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.23 
 
 
204 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.33 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51788  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.17 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  26.43 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  31.93 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  32.46 
 
 
139 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  32.46 
 
 
139 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 
133 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  32.46 
 
 
139 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  29.09 
 
 
137 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  31.07 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  32.46 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  32.46 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  28.97 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  29.71 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  26.03 
 
 
134 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  30.7 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3057  glyoxalase family protein  28.48 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  25 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.81 
 
 
334 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  27.27 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.8 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.2 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.36 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  31.82 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0029  glyoxalase family protein  33.88 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.42 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.09 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.25 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  28.06 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.37 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.68 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3232  glyoxylase family protein  26.12 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0683516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  28.16 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 
165 aa  42  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0026  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.78 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.93 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  28.04 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.14 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>