51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2113 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
204 aa  416  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.71 
 
 
166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.02 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  48.75 
 
 
199 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3057  glyoxalase family protein  45.91 
 
 
171 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.51 
 
 
176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2939  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.21 
 
 
190 aa  158  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054707  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.49 
 
 
334 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
326 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.75 
 
 
190 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.09 
 
 
172 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.81 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.77 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.85 
 
 
175 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
150 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.38 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0870171  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.74 
 
 
545 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 
129 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.87 
 
 
129 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.66 
 
 
135 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  34.23 
 
 
145 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  25.73 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.58 
 
 
137 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.15 
 
 
333 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  25.15 
 
 
160 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  25.15 
 
 
160 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  27.85 
 
 
139 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  28.48 
 
 
139 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.84 
 
 
747 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  35.19 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  28.48 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  27.85 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  26.92 
 
 
137 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  29.91 
 
 
134 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4733  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.69 
 
 
140 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232929  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.43 
 
 
136 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.135989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 
129 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  24.24 
 
 
142 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  26.58 
 
 
139 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  26.58 
 
 
139 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.66 
 
 
180 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 
134 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.33 
 
 
127 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  56.25 
 
 
143 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.33 
 
 
137 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.33 
 
 
139 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.33 
 
 
137 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.33 
 
 
137 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.71 
 
 
147 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.68 
 
 
176 aa  41.2  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>