More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1902 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
747 aa  1562    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0095  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.04 
 
 
372 aa  111  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  33.02 
 
 
201 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  31.63 
 
 
201 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30 
 
 
193 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.7 
 
 
199 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.17 
 
 
199 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  30.81 
 
 
198 aa  98.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  28.85 
 
 
315 aa  96.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.96 
 
 
341 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  29.25 
 
 
196 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0624  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.32 
 
 
331 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  25.37 
 
 
315 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.06 
 
 
338 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  33.07 
 
 
318 aa  94  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  33.07 
 
 
318 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.29 
 
 
313 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  32.29 
 
 
313 aa  92.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.67 
 
 
317 aa  91.3  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  32.67 
 
 
318 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  28.04 
 
 
205 aa  91.3  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  28.75 
 
 
320 aa  90.9  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  27.27 
 
 
311 aa  89.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.56 
 
 
334 aa  89  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  0.106477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  31.58 
 
 
318 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.08 
 
 
317 aa  88.6  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  31.58 
 
 
318 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.42 
 
 
315 aa  87.4  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  31.08 
 
 
335 aa  87  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.23 
 
 
317 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  28.19 
 
 
314 aa  87  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  31.17 
 
 
318 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  28.19 
 
 
311 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.22 
 
 
316 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  29.91 
 
 
208 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  30.93 
 
 
199 aa  85.9  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  27.89 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  31.17 
 
 
318 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  27.76 
 
 
310 aa  85.9  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.58 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  27.89 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  27.96 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.33 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  31.43 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.44 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  29.87 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.95 
 
 
314 aa  84  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  27.6 
 
 
311 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  28.79 
 
 
311 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  28.23 
 
 
316 aa  84  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.38 
 
 
308 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  30.77 
 
 
318 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  28.48 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  28.48 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.86 
 
 
318 aa  83.2  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  30 
 
 
207 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  28.48 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  28.48 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.47 
 
 
311 aa  83.2  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.01 
 
 
321 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  26.28 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  28.79 
 
 
311 aa  83.2  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  28.08 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  29.7 
 
 
356 aa  83.2  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  28.79 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  28.48 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  28.48 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.78 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 
198 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  29.02 
 
 
194 aa  82.4  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  29.63 
 
 
310 aa  82  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.78 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.99 
 
 
191 aa  82  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3262  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.33 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.487952 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.82 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1461  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  25.83 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.78 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.03 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6062  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.5 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  30.04 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.95 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  31.28 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3071  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.61 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.474461  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0083  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.06 
 
 
313 aa  80.5  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0152  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.18 
 
 
392 aa  80.5  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.693179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.54 
 
 
225 aa  80.5  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  28.46 
 
 
313 aa  79.7  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  26.89 
 
 
314 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.34 
 
 
202 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  28.69 
 
 
323 aa  79  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1486  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.59 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02361  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.51 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3240  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.72 
 
 
302 aa  79  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206902  normal  0.22308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  28.64 
 
 
198 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  28.86 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  26.27 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.74 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  28.29 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  27.17 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>