More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2739 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  93.53 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  53.27 
 
 		 196 aa  224  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  51.52 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  52 
 
 		 205 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  47.72 
 
 		 198 aa  201  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  52.53 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.22 
 
 		 225 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.73 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.67 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.64 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  46 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.23 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  46.67 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  46.67 
 
 		 197 aa  167  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.94 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  41.12 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.09 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.38 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  43.01 
 
 		 254 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  44.44 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  40.59 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  41.62 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.3 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.63 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  36.41 
 
 		 329 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 349 aa  124  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  34.72 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.76 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.14 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.05 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 344 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 341 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  36.08 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  35.71 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 348 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 328 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  34.03 
 
 		 327 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 317 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 358 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.9 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 321 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 367 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 368 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 368 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 368 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.1 
 
 		 338 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.02 
 
 		 747 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 361 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 367 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 328 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33 
 
 		 227 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 316 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 331 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 336 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 368 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 319 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  31.82 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 		 341 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 348 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 321 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 315 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 338 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 336 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 349 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  31 
 
 		 367 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 320 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 327 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 387 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  31.96 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.05 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  31 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  35.05 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 364 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  31.96 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 321 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 319 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 325 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  34.93 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 324 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 367 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 341 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 325 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 330 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>