More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1334 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  49.75 
 
 
198 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  54.77 
 
 
198 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  54.27 
 
 
198 aa  184  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.43 
 
 
199 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.67 
 
 
199 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  53.09 
 
 
197 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  50.25 
 
 
198 aa  175  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.25 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  44.44 
 
 
201 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  44.88 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  43.88 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  42.93 
 
 
201 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  41.92 
 
 
198 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.6 
 
 
193 aa  154  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.41 
 
 
228 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  43.08 
 
 
329 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  40.91 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  42.19 
 
 
194 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.11 
 
 
207 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.72 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  40.2 
 
 
208 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  45.77 
 
 
207 aa  136  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  38.92 
 
 
239 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  39.38 
 
 
254 aa  131  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.89 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.9 
 
 
233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  37.11 
 
 
218 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.36 
 
 
191 aa  121  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  36.6 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  36.98 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 
228 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 
228 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.41 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
320 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
336 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 
336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  34.48 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  35.33 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  36.36 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.26 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  33.51 
 
 
349 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  34.73 
 
 
241 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  34.92 
 
 
225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 
325 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
322 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
319 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  34.38 
 
 
229 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 
362 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.34 
 
 
231 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  34.52 
 
 
334 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 
328 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.98 
 
 
225 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
322 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 
348 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.68 
 
 
224 aa  104  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  36.52 
 
 
320 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  32.31 
 
 
233 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 
323 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 
331 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  34.21 
 
 
228 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 
327 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 
224 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  32.11 
 
 
226 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.92 
 
 
225 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
322 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  33.51 
 
 
326 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  35.43 
 
 
234 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  33.68 
 
 
238 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  31.96 
 
 
234 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  34.2 
 
 
321 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
324 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 
321 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.2 
 
 
251 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 
321 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.29 
 
 
249 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.43 
 
 
234 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  32.81 
 
 
316 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  32.29 
 
 
243 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
246 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 
324 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 
324 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  32.64 
 
 
321 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.93 
 
 
747 aa  98.2  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  32.63 
 
 
232 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
321 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  32.63 
 
 
232 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  32.63 
 
 
232 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  32.63 
 
 
242 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  34.38 
 
 
319 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  32.63 
 
 
242 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  32.63 
 
 
242 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  32.63 
 
 
691 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  34.01 
 
 
232 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
387 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 
334 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>