More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3642 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95.54 
 
 		 224 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  89.69 
 
 		 226 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  67.73 
 
 		 228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  67.27 
 
 		 232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  67.27 
 
 		 232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  67.27 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  67.27 
 
 		 242 aa  287  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  66.82 
 
 		 691 aa  287  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  66.82 
 
 		 242 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.71 
 
 		 225 aa  286  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  66.82 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  65.61 
 
 		 225 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  66.67 
 
 		 238 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  65.14 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  64.38 
 
 		 220 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.88 
 
 		 227 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  61.88 
 
 		 227 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.88 
 
 		 227 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  61.64 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  61.36 
 
 		 233 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.18 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.95 
 
 		 227 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.55 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  56.13 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  61.43 
 
 		 227 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  60 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  57.87 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.79 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  55.86 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  55.86 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  54.38 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  54.38 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  47.47 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  47.47 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  54.34 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.34 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  48.42 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  58.08 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  49.54 
 
 		 276 aa  207  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.3 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  49.54 
 
 		 238 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.4 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  51.47 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  50.45 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  55.68 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  52.74 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  51.34 
 
 		 239 aa  197  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  52.36 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.27 
 
 		 276 aa  194  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.56 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.84 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.44 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.83 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.54 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  55.1 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  42.79 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  45.41 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  49.72 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  55.7 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  45.27 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  43.63 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  43.68 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.68 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.62 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.68 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.78 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.33 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  43.81 
 
 		 326 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.64 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.81 
 
 		 284 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  43.84 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.81 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.34 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  43.81 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.81 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.57 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  41.75 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.27 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  40.41 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  40.4 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.88 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.42 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  35.48 
 
 		 241 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0761  DJ-1/PfpI family protein  43.69 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0688  putative isonitrile hydratase  43.69 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 297 aa  121  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.89 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2029  putative isonitrile hydratase  43.69 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1054  DJ-1/PfpI family protein  43.69 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0777  putative isonitrile hydratase  43.69 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1771  DJ-1/PfpI family protein  43.69 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2062  DJ-1/PfpI family protein  43.69 
 
 		 636 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>