More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0031 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  100 
 
 
232 aa  457  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  49.32 
 
 
229 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  48.87 
 
 
234 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  49.77 
 
 
232 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.15 
 
 
225 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  48.4 
 
 
228 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.17 
 
 
224 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.36 
 
 
227 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  51.36 
 
 
227 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.36 
 
 
227 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  50.48 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  51.47 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  49.07 
 
 
232 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  49.07 
 
 
232 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  49.07 
 
 
242 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  49.07 
 
 
691 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  48.6 
 
 
232 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  48.6 
 
 
242 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  48.6 
 
 
242 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  55.5 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  49.77 
 
 
226 aa  194  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  47.22 
 
 
228 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  47.22 
 
 
228 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  44.09 
 
 
233 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  47.6 
 
 
225 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  47.09 
 
 
233 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.68 
 
 
227 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.08 
 
 
232 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.11 
 
 
227 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  46.38 
 
 
220 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  48.54 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.6 
 
 
225 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  40.89 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  40.89 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.17 
 
 
227 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.67 
 
 
232 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.62 
 
 
231 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  40.74 
 
 
231 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  47.55 
 
 
239 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.72 
 
 
242 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 
285 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  47.69 
 
 
242 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  50.91 
 
 
227 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  43.95 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.12 
 
 
276 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  43.84 
 
 
261 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.24 
 
 
231 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.4 
 
 
234 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  47.4 
 
 
234 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.63 
 
 
262 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  44.78 
 
 
243 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  43.75 
 
 
228 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  53.01 
 
 
201 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  43.75 
 
 
228 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  44.33 
 
 
212 aa  154  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  41.43 
 
 
276 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.15 
 
 
239 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  48.29 
 
 
261 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.94 
 
 
234 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.42 
 
 
277 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.94 
 
 
234 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  43 
 
 
241 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.89 
 
 
246 aa  148  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  41.06 
 
 
279 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  44.1 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.1 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.1 
 
 
245 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.2 
 
 
284 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.2 
 
 
284 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.37 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  40.2 
 
 
326 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  48.63 
 
 
201 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.03 
 
 
251 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.66 
 
 
231 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  41.18 
 
 
222 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.78 
 
 
230 aa  134  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  44.04 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  38.66 
 
 
284 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.66 
 
 
284 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.69 
 
 
284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  42.86 
 
 
233 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
209 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  40.31 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  42.55 
 
 
214 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.5 
 
 
233 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.29 
 
 
210 aa  121  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.25 
 
 
226 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  36.82 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.57 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.11 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.9 
 
 
199 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  36.76 
 
 
329 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  36.82 
 
 
205 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  34.93 
 
 
297 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  39.5 
 
 
207 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  33.52 
 
 
241 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  32.98 
 
 
196 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  32.97 
 
 
241 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  32.47 
 
 
202 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>