More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2555 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  56.85 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  60 
 
 		 242 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.28 
 
 		 276 aa  234  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  56.56 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  60 
 
 		 224 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  58 
 
 		 224 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  53.78 
 
 		 234 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  49.55 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  46.82 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  46.82 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  54.55 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  53.7 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  55 
 
 		 225 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  50.68 
 
 		 232 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  53.47 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.47 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  49.12 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  48.91 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.12 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.12 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  47.54 
 
 		 691 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  48.47 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  48.47 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  48.47 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  50.45 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  48.03 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  48.03 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  52.02 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  40.16 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.83 
 
 		 225 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  48.15 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.09 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  44.93 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  43.53 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.45 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.53 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.52 
 
 		 227 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  50.75 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.02 
 
 		 231 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  48.67 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  45 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.48 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  45 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.5 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.94 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  46.56 
 
 		 229 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  45.69 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  44.88 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  44.55 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  48.22 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  48.22 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.15 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  46.15 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  43.94 
 
 		 228 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.63 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.29 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.15 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.54 
 
 		 231 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.35 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.35 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  46.35 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  44.9 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.09 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  55.1 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.47 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  40.65 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 233 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.9 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  41.97 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.88 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  41.75 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  37.82 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  41.43 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  37.56 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.05 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.05 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  41.01 
 
 		 187 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.57 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  38.15 
 
 		 199 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1802  putative transcription regulator protein  37.75 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 		 207 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  29.84 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  29.32 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.26 
 
 		 188 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0777  putative isonitrile hydratase  34.5 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.38 
 
 		 198 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 358 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.99 
 
 		 199 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0320  putative transcription regulator protein  32.7 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.330928  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0761  DJ-1/PfpI family protein  32.74 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>