More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3686 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
239 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  97.01 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96.58 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  48.04 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  48.04 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  45.85 
 
 
229 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  42.98 
 
 
231 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  43.27 
 
 
233 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  42.31 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  41.63 
 
 
691 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  41.63 
 
 
232 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  42.11 
 
 
238 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  41.63 
 
 
232 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  41.63 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  41.63 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  41.15 
 
 
242 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  41.15 
 
 
232 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.49 
 
 
227 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  40.49 
 
 
227 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.49 
 
 
227 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  41.26 
 
 
233 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  43.41 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  40.48 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  39.91 
 
 
285 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  40.98 
 
 
228 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.62 
 
 
276 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  42.16 
 
 
232 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  38.29 
 
 
279 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.1 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  37.89 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  42.86 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.01 
 
 
224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  38.16 
 
 
225 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.78 
 
 
225 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.46 
 
 
227 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.98 
 
 
227 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  41.45 
 
 
226 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.23 
 
 
231 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.09 
 
 
227 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.62 
 
 
277 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 
262 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  38.83 
 
 
241 aa  155  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  39.9 
 
 
232 aa  152  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  41.38 
 
 
239 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  37.31 
 
 
243 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.04 
 
 
242 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  34.3 
 
 
220 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.68 
 
 
249 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.58 
 
 
234 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  41.75 
 
 
227 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  37.37 
 
 
229 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  34.58 
 
 
234 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.69 
 
 
230 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  40.2 
 
 
228 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  40.2 
 
 
228 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.62 
 
 
245 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  38.62 
 
 
245 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.7 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.79 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  37.04 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.1 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  36.74 
 
 
212 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  33.99 
 
 
228 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  33.99 
 
 
228 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  35.5 
 
 
228 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  38.53 
 
 
261 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  42.68 
 
 
201 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.06 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  35.51 
 
 
326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  33.97 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.1 
 
 
284 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  34.1 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.1 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  34.38 
 
 
198 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  34.22 
 
 
241 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.18 
 
 
231 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 
209 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.88 
 
 
284 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.88 
 
 
284 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  34.22 
 
 
241 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.19 
 
 
232 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  38.42 
 
 
233 aa  121  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.08 
 
 
251 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  41.06 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.62 
 
 
233 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  35.29 
 
 
214 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
198 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.53 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  33.68 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  34.05 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.85 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  33.65 
 
 
222 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.48 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1802  putative transcription regulator protein  37.25 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.5 
 
 
199 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  28.93 
 
 
218 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.13 
 
 
210 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 
311 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 
311 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>