More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1474 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  457  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  71.49 
 
 
231 aa  324  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  59.65 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  59.65 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.3 
 
 
232 aa  262  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  57.2 
 
 
238 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  53.02 
 
 
224 aa  205  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.56 
 
 
224 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  52.66 
 
 
691 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  52.66 
 
 
232 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  52.66 
 
 
232 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  50.22 
 
 
234 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  52.66 
 
 
242 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  52.17 
 
 
232 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  52.17 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  52.17 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  48.67 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  51.17 
 
 
227 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.17 
 
 
227 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.17 
 
 
227 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  51.85 
 
 
226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  51.69 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  46.49 
 
 
228 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  59.75 
 
 
201 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.3 
 
 
227 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  46.08 
 
 
232 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  45.91 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.49 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.83 
 
 
227 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.78 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  44.69 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  49.28 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  47.66 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.81 
 
 
284 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.21 
 
 
227 aa  174  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.81 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  46.19 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  42.92 
 
 
326 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  46.11 
 
 
228 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  46.11 
 
 
228 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  44.49 
 
 
233 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.65 
 
 
284 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  50.68 
 
 
227 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  42.65 
 
 
284 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.65 
 
 
284 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.49 
 
 
230 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 
231 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  46.43 
 
 
229 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.38 
 
 
234 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.29 
 
 
276 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  43.38 
 
 
234 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  46.89 
 
 
228 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  46.89 
 
 
228 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  47.39 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.05 
 
 
231 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  44.39 
 
 
242 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  44.66 
 
 
261 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.47 
 
 
242 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  39.65 
 
 
241 aa  147  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  38.24 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  43.2 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  40.43 
 
 
276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.33 
 
 
277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 
239 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  43.69 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.56 
 
 
234 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.96 
 
 
262 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  40.54 
 
 
228 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  39 
 
 
243 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.56 
 
 
234 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.38 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  41.36 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.36 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.84 
 
 
245 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.37 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  43.41 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  37.95 
 
 
233 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  44.68 
 
 
261 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  39.36 
 
 
214 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.58 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  43.72 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.23 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.66 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  37.37 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  33.16 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.95 
 
 
226 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  35.29 
 
 
218 aa  104  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
209 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.35 
 
 
198 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  35.5 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  34.18 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  36.08 
 
 
209 aa  92.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1802  putative transcription regulator protein  35.12 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 
351 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.14 
 
 
233 aa  89  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  31.68 
 
 
202 aa  89  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  36.09 
 
 
187 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2559  ThiJ/PfpI  46.03 
 
 
148 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>