More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0469 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.21 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  43.33 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  45.16 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.55 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.32 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  44.97 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  38.14 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  36.57 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  38.14 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  38.14 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  37.67 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  38.24 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  37.67 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  37.67 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  37.67 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  38.68 
 
 		 691 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.32 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  35.91 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  37.32 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.32 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  37.9 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.83 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.82 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 		 276 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  43.55 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.55 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  38.22 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  39.18 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.01 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.73 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  37.73 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.06 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  35.12 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  38.89 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.07 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  38.92 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  36.94 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  38.16 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.73 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  35.05 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  35.05 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.03 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.32 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  40.48 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  37.89 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  32.87 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  27.65 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  27.65 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  36.89 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.63 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  30.89 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  34.3 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  33.8 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  33.8 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.12 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  35.45 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  34.68 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  39.59 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.92 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.06 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.72 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  33.85 
 
 		 261 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.72 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.72 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  35 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  36.54 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.76 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  33.67 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  34.33 
 
 		 326 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  34.13 
 
 		 187 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.02 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.49 
 
 		 284 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.49 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  34.5 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  31.05 
 
 		 285 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.5 
 
 		 284 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.97 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  32.26 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2559  ThiJ/PfpI  45.67 
 
 		 148 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.74 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  31.61 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  29.86 
 
 		 276 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  28.43 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 209 aa  85.5  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  34.63 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  27.94 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>