More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0140 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  80.89 
 
 		 227 aa  384  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.75 
 
 		 241 aa  300  9e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.38 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  44.5 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  43.88 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  43.3 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  41.97 
 
 		 202 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  39.29 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  35.68 
 
 		 284 aa  122  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 193 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.52 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.26 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.59 
 
 		 234 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  34.59 
 
 		 234 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  34.95 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  34.57 
 
 		 199 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.55 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.36 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.72 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.65 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  35.71 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  32.5 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  35.16 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.16 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  32.62 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  32.62 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.16 
 
 		 245 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  34.25 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  31.96 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  31.96 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  31.96 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  31.96 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  31.96 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  31.96 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.52 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  32.64 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  33.52 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.52 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  30.5 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  30.93 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.37 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.7 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.62 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  32.42 
 
 		 691 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  34.62 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 320 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  34.04 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.14 
 
 		 276 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  32.97 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  30.22 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  32.32 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.47 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  31.44 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  35.48 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  33.15 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.03 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  36.65 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  31.89 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.51 
 
 		 191 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  30.2 
 
 		 239 aa  88.2  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.89 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  28.33 
 
 		 329 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.89 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  34.68 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.6 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.15 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  30.48 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  31.87 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  26.78 
 
 		 341 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 349 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.88 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  31.55 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.62 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  32.8 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  28.5 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  31.79 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.09 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.06 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.61 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 322 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  32.12 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  32.24 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  28 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  31.35 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.07 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>