More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2019 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 204 aa  390  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  63.92 
 
 		 199 aa  238  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  50.53 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  37.82 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.29 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.62 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.55 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.9 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  39.81 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  40.86 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  41.3 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  40.8 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  42.47 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  37.88 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.7 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.74 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.27 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.94 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  40.2 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  32.18 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  32.18 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  41.54 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  38.65 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.65 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.65 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.24 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  41.81 
 
 		 224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.55 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  40.12 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  40.88 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.65 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.13 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.7 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.38 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  37.11 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  35.83 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  36.41 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  43.58 
 
 		 320 aa  104  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 349 aa  104  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  42.69 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  40.32 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  36.27 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  42.11 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  42.11 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  42.11 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  42.11 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  42.11 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  42.61 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  42.11 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  34.57 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  36.56 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  42.11 
 
 		 691 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.77 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.28 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.13 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.28 
 
 		 234 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  35.11 
 
 		 254 aa  98.2  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  29.17 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  36.92 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  37.17 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  35.29 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  34.3 
 
 		 329 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.57 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  28.12 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.61 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.68 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.61 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 321 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 321 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 321 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.26 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 329 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.3 
 
 		 338 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  39.04 
 
 		 328 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 335 aa  91.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 312 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 297 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 319 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  37.13 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.9 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 331 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.14 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  32.45 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.32 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 319 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  30.73 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  37.32 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3446  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.32 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.458276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  39.25 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  39.25 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.78 
 
 		 276 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>