More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6177 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
207 aa  418  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  48.97 
 
 
202 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.49 
 
 
207 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
198 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  51.78 
 
 
207 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.5 
 
 
199 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.77 
 
 
199 aa  167  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  46.53 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  42.42 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  47.5 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  41.62 
 
 
201 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  47.5 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.21 
 
 
228 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  41.62 
 
 
201 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  46.83 
 
 
198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  47 
 
 
197 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.41 
 
 
193 aa  154  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.47 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.91 
 
 
210 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  37.95 
 
 
198 aa  148  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.15 
 
 
191 aa  141  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  41.92 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.75 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  38.24 
 
 
233 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.97 
 
 
234 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  38.97 
 
 
234 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  41.29 
 
 
208 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 
225 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  40.51 
 
 
220 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.53 
 
 
225 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  39.9 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.7 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  35.38 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  39.18 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  38.97 
 
 
224 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  34.02 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  34.02 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  45.77 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  40.31 
 
 
225 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  39.18 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  35.35 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  38.66 
 
 
238 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  37.63 
 
 
329 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.8 
 
 
233 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  32.2 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  39.5 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  37.11 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  37.11 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  37.11 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.06 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  37.11 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  37.11 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  37.06 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.06 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  37.11 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  37.88 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  37.31 
 
 
691 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  40.59 
 
 
239 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  43.01 
 
 
228 aa  124  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  43.01 
 
 
228 aa  124  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  31.71 
 
 
241 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  38.07 
 
 
199 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  38.97 
 
 
199 aa  122  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  36.08 
 
 
228 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 
348 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 
209 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.68 
 
 
239 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.68 
 
 
225 aa  121  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  34.34 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  38.46 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 
331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
328 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  36.41 
 
 
322 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
338 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  32.66 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 
324 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
322 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
324 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
324 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.52 
 
 
338 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 
323 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  35.2 
 
 
233 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  35.68 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  33.66 
 
 
334 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.59 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.9 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.89 
 
 
230 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  35.9 
 
 
261 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  37.13 
 
 
243 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.84 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  38.66 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  34.69 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 
338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>