More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2951 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 254 aa  527  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  43.01 
 
 		 201 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  43.52 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  41.12 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  45.79 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  39.06 
 
 		 205 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  39.35 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.43 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.8 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  38.71 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  44.21 
 
 		 197 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.55 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.34 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  41.97 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  36.9 
 
 		 194 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.16 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  41.45 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.44 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  36.22 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  36.22 
 
 		 202 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.83 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  39.18 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  39.38 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 327 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.04 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.95 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.46 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  35.52 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.33 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  36.84 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  35.85 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.85 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  35.6 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.11 
 
 		 444 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 328 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.39 
 
 		 198 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  34.76 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  34.76 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 319 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 349 aa  99.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.35 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.96 
 
 		 226 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 321 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 331 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  31.72 
 
 		 199 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  35.75 
 
 		 238 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  34.87 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 307 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 320 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  33.85 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 319 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 492 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  37.43 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 356 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  34.72 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  34.72 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.46 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  34.72 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 336 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.38 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  34.72 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  34.72 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  35.11 
 
 		 691 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  34.04 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  35.38 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  34.72 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.92 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.38 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.28 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 333 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  34.03 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 327 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  34.41 
 
 		 243 aa  92  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.77 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  34.07 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 336 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.77 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 331 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.04 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 338 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  30.52 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  36.7 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.7 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>