More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4645 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 492 aa  975    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.25 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.74 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4743  ThiJ/PfpI  28.53 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3423  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.82 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2645  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.01 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.95 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  27.64 
 
 		 366 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2944  ThiJ/PfpI  27.96 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  30.73 
 
 		 196 aa  87.8  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.81 
 
 		 199 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  28.85 
 
 		 198 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3893  ThiJ/PfpI domain protein  28.79 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4364  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.54 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  34.83 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.79 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  30.96 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  33.33 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  33.51 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.69 
 
 		 207 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  28.85 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  32.02 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  27.62 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  32.04 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  32.07 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 323 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.64 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  37.1 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  35.75 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  29.95 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  42.39 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.51 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  33.79 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  34.03 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  27.87 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  29.89 
 
 		 201 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  44.09 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  42.39 
 
 		 315 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 320 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 245 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 317 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  33.33 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.51 
 
 		 231 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  27.96 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  30.72 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  36.29 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.63 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 322 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 335 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  33.86 
 
 		 333 aa  67  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 321 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  33.33 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>