More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2400 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 444 aa  909    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  33.07 
 
 		 492 aa  193  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4743  ThiJ/PfpI  30.51 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3423  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.51 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.51 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  29.54 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.26 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2645  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.39 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3893  ThiJ/PfpI domain protein  30.66 
 
 		 385 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.5 
 
 		 199 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 198 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.34 
 
 		 199 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  32.11 
 
 		 254 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2944  ThiJ/PfpI  26.97 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245807  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4364  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.56 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  29.51 
 
 		 198 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.77 
 
 		 198 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  31.52 
 
 		 198 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  31.77 
 
 		 197 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 331 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  30.37 
 
 		 202 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  32.65 
 
 		 239 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.75 
 
 		 193 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  29.06 
 
 		 205 aa  93.2  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  28.4 
 
 		 201 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  28.8 
 
 		 201 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  32.81 
 
 		 329 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  31.77 
 
 		 198 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  28.11 
 
 		 196 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  31.75 
 
 		 207 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 348 aa  89.7  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  31.44 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 198 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.81 
 
 		 234 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.14 
 
 		 234 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  43.69 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  25.88 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.31 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  27.37 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  31.05 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.71 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  30.17 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  30.88 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  32.47 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 326 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 326 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  29.61 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.94 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  29.61 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  31.85 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  32.45 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  29.05 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  29.05 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  29.05 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  29.05 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  35.59 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.01 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>