More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2626 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  90.95 
 
 		 199 aa  362  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  44.67 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  44.67 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  46.39 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  48.21 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.26 
 
 		 193 aa  177  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.45 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.79 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  47.45 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  48.21 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  48.72 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  43.01 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  41.88 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  40.31 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  46.43 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.92 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.89 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  45.41 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  45.77 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  40.53 
 
 		 194 aa  148  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  39.79 
 
 		 329 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  42.08 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  44.97 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  42.71 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.41 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  43.52 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.23 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.68 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.57 
 
 		 349 aa  134  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.16 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 322 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 324 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 324 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 324 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  35.08 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  34.21 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  38.34 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  39.27 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  40.53 
 
 		 327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.3 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.82 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 		 323 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  38.58 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.54 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 322 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.93 
 
 		 338 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.37 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  39.49 
 
 		 225 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.52 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 316 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 322 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  39.47 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  34.9 
 
 		 228 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  34.9 
 
 		 228 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  33.86 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 362 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  33.67 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  41.27 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 321 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 336 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 311 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 311 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.43 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 341 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.05 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  38.3 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  38.3 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.05 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 319 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  38.46 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 321 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.46 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 321 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.46 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  38.3 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  38.3 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  38.3 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  38.3 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  38.3 
 
 		 242 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  35.9 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 338 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 320 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  43.16 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  35.94 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 312 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  39.9 
 
 		 338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  34.21 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.02 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  36.13 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  37.77 
 
 		 691 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 327 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 358 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>