More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2954 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  93.53 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  51.76 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  51.01 
 
 		 194 aa  211  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  50 
 
 		 205 aa  210  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.22 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  46.19 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  51.01 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.65 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.67 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.25 
 
 		 226 aa  177  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  46.15 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  43.5 
 
 		 239 aa  167  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  46.91 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.67 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.43 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  39.59 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  43.52 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.37 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  39.11 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  41.62 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.44 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.82 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  42.93 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.81 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.78 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  34.87 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  35.75 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  36.6 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 349 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.54 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  34.69 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 341 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.08 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 344 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 341 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  32.32 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 358 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  32.98 
 
 		 327 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 319 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 368 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 334 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 364 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 328 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 348 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  32.83 
 
 		 317 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 321 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 321 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 348 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  36.98 
 
 		 349 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 368 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 334 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 316 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 367 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 338 aa  104  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 319 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.63 
 
 		 747 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  31.63 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  32.14 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  32.14 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  32.14 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 341 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  31.63 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 367 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  31.63 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  31.63 
 
 		 691 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 336 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 320 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  31.77 
 
 		 328 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  29.5 
 
 		 367 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  30.41 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  30.41 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 325 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  33.16 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 367 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  34.55 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 315 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  33.67 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 331 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>